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Instalação
- Faça o download da imagem em seu computador:
docker pull registry.codigos.ufsc.br/bioinfo/gromacs-2022.2:latest
Utilização
- Para utilizar o serviço, deve ser iniciado o container, compartilhando o diretório dos modelos com a pasta
/input
do mesmo e executado o comando para inicialização do processamento:
docker run -v "/home/modelos:/input" --rm -w /input -it registry.codigos.ufsc.br/bioinfo/gromacs-2022.2:latest bash -c "gmx pdb2gmx -f KALP-15_princ.pdb -o KALP-15_processed.gro -ignh -ter -water spc"
(Nota: Os modelos estavam no diretório /home/modelos
do host e foi executado o comando gmx pdb2gmx -f KALP-15_princ.pdb -o KALP-15_processed.gro -ignh -ter -water spc
.)