Create Fastqc authored by Bruno da Silva Castilho's avatar Bruno da Silva Castilho
#### Modo de uso
1. Faça o download da imagem em seu computador:
```
docker pull registry.codigos.ufsc.br/bioinfo/fastqc
```
2. Crie um diretório de trabalho(`$HOME/fastqc`) em seu computador e copie os seus arquivos de trabalho para ele.
```
mkdir $HOME/fastqc
cd $HOME/fastqc
```
3. Inicie o container com o comando abaixo. Ao iniciar o container, você terá acesso ao bash do mesmo, podendo com isso executar o programa `fastqc`, fornecido por ele.
```
docker run -it -v $HOME/fastqc:/input registry.codigos.ufsc.br/bioinfo/fastqc -rm
```
> Ao iniciar o container você estará localizado no diretório **/input**, o mesmo está sendo compartilhado com o diretório **$HOME/fastqc** do seu computador. Ou seja se você executar o comando **ls** na pasta **/input** do **container**, todos os arquivos do diretório **$HOME/fastqc** do **host**, estarão lá e vice e versa.
4. Para sair e finalizar o container, execute o comando abaixo.
```
exit
```
\ No newline at end of file